Χωρίς άδεια λειτουργούσε η δομή της Κιβωτού του Κόσμου στην Κόνιτσα Ιωαννίνων. Οι έλεγχοι των αρμόδιων υπηρεσιών το 2020 διαπίστωσαν ότι δεν υπάρχει το κατάλληλο προσωπικό καθώς και προβλήματα στην κτιριακή εγκατάσταση.
Στην δομή της Κόνιτσας φιλοξενούνται ακόμη και σήμερα αρκετά παιδιά. Σε ερώτηση προς τις αρμόδιες υπηρεσίες για το αν διενεργήθηκαν έλεγχοι μετά το 2020 στην δομή, οι αρμόδιοι απάντησαν πως δεν μπορούσε να πραγματοποιηθεί έλεγχος σε δομή που δεν έχει άδεια λειτουργίας.
Στην αντίστοιχη δομή της “Κιβωτού του Κόσμου” στην Πωγωνιανή Ηπείρου, υπάρχει άδεια φιλοξενίας παιδιών, αλλά όχι κάτω των 5 ετών, καθώς κι εκεί διαπιστώθηκε πρόβλημα με το επιστημονικό προσωπικό που ήταν απαραίτητο. Παρ’ όλα αυτά, στην δομή της Πωγωνιανής, φιλοξενούνται παιδιά κάτω των 5 ετών. Η δομή της Πωγωνιανής έκανε το 2015 νέο αίτημα για αδειοδότηση φιλοξενίας παιδιών κάτω των 5 ετών, το οποίο απορρίφθηκε επίσης.